台灣民主基金會是由外交部推動籌設，並在國民黨執政的2003年經由立法院審查通過預算後正式成立，是亞洲第一個國家級民主基金會，宗旨是推動與全球民主接軌並鞏固台灣的民主實績。歷任董事長依慣例都由現任的立法院長擔任，現任董事長是韓國瑜，副董事長則由外交部長林佳龍擔任，董事會成員包含政府代表、學界代表、民間團體代表，以及按國會席次比例分配的政黨代表，現任執行長則是由韓國瑜推薦的前中山大學政治系教授廖達琪擔任。
基金會的經費多來自於外交部，設立初始資金為3,000 萬元，目前每年原則上由外交部編列 1.5億元台幣作為運作經費，預算中保留約3千萬提供給各政黨申請從事民主人權相關活動。
據《財團法人台灣民主基金會政黨補助計畫作業要點》規定，可補助的計畫類別共有5項，分別為「各政黨從事國會外交及國內外民主人權交流等活動」、「有關民主與人權之研討會、公共論壇及相關民主教育活動」、「有關民主、人權議題之學術研究、調查及出版」、「有關提升臺灣民主、人權發展，與國際接軌之相關活動」、「有關提升臺灣國際地位及能見度之相關活動」。
實務上，基金會在審核這些政黨申請經費時都會盡量從寬解釋，但也因此曾在立法院引發爭議。例如，2024年初，國民黨立委王鴻薇與徐巧芯就指控，民進黨申請近千萬元補助，名目包括「國務青旗艦營」等與國會外交毫無關聯的活動，這機構根本是「民進黨的小金庫」。不過，民進黨也反控，國民黨歷年也都向民主基金會申請滿額的上千萬補助，其中「英文資訊發布與英文網頁建置」，「英（日）文資訊與英（日）文網頁內容更新」等行政費用也都來申請，才是讓人笑掉大牙。
知情人士表示，也不過才一個多月前，閣揆卓榮泰訪日，完成台日斷交以來最重大的外交突破，卻因為總預算被卡，被迫以私人荷包支付214萬的包機費用；如今，仍屬於民間團體的政黨主席赴中參拜獨裁者，卻變相由國庫支付480萬的訪團費用，這兩件事應該接受公評。
